Covid-Out est un site gratuit conçu par des professionnels de la santé, des chercheurs et des experts, qui a pour objectif de fournir des ressources concrètes et personnalisées pour vous aider à maintenir un équilibre de vie et vous adapter à la situation exceptionnelle que nous vivons, et ses évolutions à venir.

Agoralogie a travaillé avec la Fondation FondaMental Suisse et l’Institut du Cerveau, de manière agile, pour expérimenter différentes stratégies de suivi, en particulier différentes modalités de Ecological Momentary Assessment, pour prototyper très rapidement ce site, décliné également pour la population suisse (www.covidout.ch)

CovidOut


Certaines planches d’herbiers présentent des spécimens de plantes protégées, très rares, et l’étiquette présente souvent le détail du lieu de récolte. La publication au grand public de ces scans serait alors un risque supplémentaire pour ces plantes.

Nous avons réalisé l’analyse des besoins et organisé les différentes étapes d’études et validations. Nous avons expérimenté différentes méthodes pour produire une image de la planche publiable sans risque. La plus efficace a été sans conteste l’apprentissage d’un réseau de neurones convolutionnel, de type SSD, qui donne des résultats extrêmement proche d’un opérateur humain.
Pour le MNHN, en partenariat avec le CNAM

Un exemple de zones repérées, avec leur probabilité d’être une étiquette


Pour respecter les consignes RGPD et garantir en même temps l’édition des images sous licence Creative Commons, nous avons repris le code du projet iHerbarium, pour le rendre entièrement publique sur GibHub.
En réécrivant une partie du projet, nous l’avons également adapté pour utiliser le référentiel taxonomique TaxRef .

Nous avons également améliorer les possibilités d’éditions d’étiquettes pour la gestion d’herbiers physiques :


Analyse de différentes techniques d’auto-évaluation pour des programme de sensibilisation à des valeurs d’une grande entreprise française. Critères : sensible, pertinent, rapide

Mise en place de QCM avec des réponses à ordonner, analyses statistiques pour vérifier que chaque question apporte des informations, et trouver le nombre minimal pour que les résultats soient significatifs. Ces résultats sont ensuite confrontés à une base de données ad hoc afin de suggérer des manières d’évoluer sur des axes sous ou sur-valorisées, à l’aide d’auto-coaching et formations.

Module livré sous forme de SCORM


Agoralogie a développé une application Smartphone connectée à un capteur geiger Buetooth, dans le cadre du projet OpenRadiation ; nous avons également programmé une partie du firmware du capteur, afin d’optimiser les échanges, en partenariat avec le FabLab de Paris 6. Tous les codes ont été publiés sur GitHub.

Vous souhaitez connaître le niveau de radioactivité autour de vous et évaluer votre exposition aux rayonnements ionisants ? L’application OpenRadiation vous permet de mesurer la radioactivité lorsqu’elle est utilisée avec un capteur compatible.

Elle vous permet également de participer à un projet de science citoyenne, en contribuant à la constitution de la base de données OpenRadiation de mesures de la radioactivité dans l’environnement (publiée en Open Database License).

Vous pourrez alors partager vos mesures à l’aide de l’application et les visualiser dans l’application ou sur le site openradiation.org.

Lien vers l’application Android   Lien vers l’application iOS

Ecran pendant la mesure


Suivre l’évolution de son TOC par smartphone

Les troubles obsessionnels compulsifs sont une maladie psychiatrique sévère et handicapante. Le thérapeute ajuste ses stratégies à l’aide d’un questionnaire standardisé. Des chercheurs de l’équipe BEBG (INSERM, ICM) travaillent sur une application smartphone pour obtenir une autoévaluation en temps réel, plus efficace, tout en renforçant le lien entre le patient et le clinicien, dans un process agile avec nous. Une première version a été longuement testée et ajustée sur 10 patients, avant un déploiement général.

Nous développons avec les outils cordova/phonegap, avec différents frameworks. Cela limite les interactions de bas-niveau avec les différents matériels, mais nous donne une grande réactivité.

                       



MulticollecteNature est une application de collecte pour smartphone permettant en quelques minutes de participer à de nombreux programmes de sciences participatives.

Les chercheurs peuvent gracieusement créer des protocoles d’études via notre site Multicollect et rendre accessible le projet.

Les citoyens peuvent ensuite utiliser notre outil de collecte pour noter des observations naturalistes, ou toute donnée environnementale. Celles-ci sont alors facilement exploitables car géolocalisées et pré-traitées.

L’application est publiée gratuitement sur github, et sera très bientôt disponible sur Android et iOS.

 


Nous avons publié sur Android et iOS une application visant à réaliser des études utilisant des protocoles d’auto-évaluations ( « Ecological momentary assessment » ).

Lien vers l’application Android

Lien vers l’appli sur iTune

Tout chercheur intéressé peut se référer au site Multicollect pour lancer son étude en quelques dizaines de minutes. La référence de protocole 216879 peut être saisi à la page « réglages-roue crantée », pour les personnes désirant expérimenter le fonctionnement et les notifications. Le petit questionnaire qui vous sera présenté vous interrogera alors sur la qualité de votre sommeil. NB : les données ne sont pas publiés, mais réservés au patient et aux praticiens autorisés par le patient.

 


Avec l’aide de Felix Geoffroy de Agro-paristech, nous avons développé des outils permettant d’estimer la richesse en espèce, pour des inventaires réalisés avec nos outils.

Par exemple, sur la page traitant du Père lachaise, on peut voir 4 estimateurs du nombres d’espèces de plantes à fleurs présentes dans le cimetière.

Ici le tracé de la progression du calcul de l’estimateur ACE au fur et à mesure de l’accumulation des relevés

Ici avec l’estimateur basé sur Chao1